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如何使用NCBI工具

2023-07-05 10:54:38    出处:互联网


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1. NCBI工具是生物信息学研究的重要工具,可以用来查找和分析生物序列信息。NCBI提供的工具包括BLAST、GenBank、Entrez等。其中,BLAST是最为著名的工具之一,可以在数据库中查找相似序列。这篇文章将简单介绍如何使用BLAST来搜索和分析生物序列信息。2. 首先,访问NCBI的网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov),在顶部的搜索栏中输入想要查询的关键词。这样可以找到大量的相关文献、序列等信息。如果要搜索特定的生物序列,可以在“BLAST”标签下选择相应的工具,比如“BLASTn”用于核酸搜索,而“BLASTp”适用于蛋白质搜索。3. 接下来,上传或输入查询序列。上传文件可以是FASTA格式,或是直接将序列复制粘贴至搜索栏中。BLAST会像搜索引擎一样,在数据库中查找与查询序列相似度最高的序列。搜索结果可以按多个参数进行筛选,如基因型、物种、文章等。4. BLAST的结果以表格形式显示,表格中包含了每个匹配的信息,如匹配度、E值、比对长度等。通过对结果的筛选与解读,可以获得目的序列的相似序列组。在得到了相似序列后,可以进一步对它们进行比对和分析。5. 总结:NCBI工具旨在为生物信息学研究人员提供全面的生物信息资源和工具。BLAST作为其中最重要的工具之一,可以帮助我们搜索和分析生物序列的相似信息,并进一步深入了解其结构与功能。

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